She works .... school.she works ..... shop.he works ..... farm.he works

She works at school, she works at a shop, he works at a farm, he works in a cafe, she works in office.    

in = в (снутри, т.е. по смыслу ближе к inside), on = на (дословно на чем-то), at = в, на (когда речь не идет о буквальном расположении снутри чего-то либо на чем-то).

Например:

I study at school.  Я учусь в школе.