Каким генам присущ третий закон Менделя? При каком расположении пар генов

Справедлив для наследования моногенных признаков (т.е. один признак -один ген). Если за один и тот же признак отвечают несколько генов (т.е. при полимерии, классический пример  - цвет кожи), его использовать нельзя. 
Если вопрос касается исключительно расположения генов, то закон не проявляется при сцепленном наследовании. Сцепление может нарушиться, если в процессе мейоза происходит кроссинговер. Чем далее удалены аллельные гены друг от друга в хромосоме, тем выше возможность кроссинговера.