почему вода прозрачная?

Вода стопроцентно состоит из водорода и кислорода. Оба элемента газы и  они являются невидимыми. Она может быть и не совсем прозрачной - содержать всякие взвеси

Поэтому что в ней нет "дырок".

Вообще-то фактически ВСЕ вещества прозрачны (не считая, понятно, металлов) , при условии, что в их нет неоднородностей, пустот и поликристаллической структуры. Потому что любые пустоты (пористость) или поверхности раздела (поликристаллы - а это хоть какой камень - или примеси - а это люая пластмасса и вообще почти всё что угодно) - это поверхность раздела, на которой свет рассеивается либо поглощается. Поэтому прозрачны только незапятнанные беспримесные минералы ("камешки незапятанной воды"), стекло, некие пластики (без заполнителей) и чистые воды - в них как раз отсутствуют неоднородности, примеси, границы раздела и иная бяка.
Вода как раз подпадает под это - в однородной среде свету просто не на чем рассеиваться, потому он так сквозь нее и проходит. Стоит только создать там границы раздела (к примеру, брать вместо воды пену либо снег) - всё, привет, возникает немеренно границ раздела вода-воздух, на которых происходит хаотическое рассеяние света, и такая среда прекращает быть прозрачной.