чем можно разъяснить свержение софьи в  1689 был ли это дворцовый

Так как Петр и его брат начали управлять в несовершелетнем возрасте то опекуншей братьев была Софья и та можно было считать что верховодит за них,потом она вообщем власть к рукам желала прибрать но это уже потом но Петр выслал её в манастырь и тем самым лешил полнамочий

1-ая причина "лежит на поверхности" - Женщина- правитель для Руси 2-ая - не так явна и лежит в области народной психологии. Софья и ее фактический соправитель Голицын (кстати, человек европейски образованный и владеющий гос мудростью) в народе ассоциировались с переменами, ломкой стереотипов, реформами. Молодой (фактически еще мальчик) Петр, а в особенности его мама Н. Нарышкина, напротив, со "ветхим, дедовским укладом". Народ смен не желал... История - дама капризная и любит злобно пошутить... 
Дворцовым переворотом это можно именовать с великий натяжкой. Скорее это - "голосование ногами". Все-таки было задействовано веское количество народа. Стрелецкие полки и остальные служилые люди просто оставили Софью в одиночестве и ушли в Лавру к Нарышкиным.