В чем были принципные разномыслия участников избранной рады и царя

Напомню, что начало правления Ивана Грозного началось с общего правления с Избранной Радой. Но в 1560 году Иван Грозный на правах законного короля решил поменять политическую систему и форму правления. Он внедрял элементы абсолютизма в свое правление. Но в первую очередь, ему необходимо было избавиться от совещательного органа Избранной Рады который ограничивал его действия.  

Он начал с репрессий против неких членов Избранной Рады: Адашевых Данилы и Алексея, Андрея Курбского. А потом он и совсем распустил Избранную Раду.

Главной (официальной) причиной роспуска Избранной Рады являются те самые несогласия, о которых идет речь в вопросе.  

Принципными несогласия соучастников Избранной рады и короля были по предлогу Ливонской войны. Например, Иван Грозный настаивал на продолжении роли Рф в войне, а Адашев наоборот, считал, что куда полезнее будет пришествие на Крым.  

Есть также слухи о том, что Иван Строгий был уверен в том, что Сильвестр и Адашев отравили его жену.  

Но по факту, Иван Строгий не желал обузы в виде Избранной Рады, ему не нужны были медлительные решения, он хотел сделать Россию сильно централизованным государством, и чтоб его решения выполнялись в миг. Роспуск Избранной Рады просто отдал ему возможность верховодить в одиночку и вести более ускоренную политику.