Как вы мыслите может ли Софья со временем простить Молчалина?

Я считаю, что нет. Если бы Молчалин испытывал к Софье хоть какие-то нежные чувства, тогда еще может быть. Но он прямодушно признается Лизаньке, что ухаживает за барыней поэтому, что, как бы мы сейчас сказали, это прибыльно. Мне о многом произнесла сцена, где Софья выгоняет Молчалина: он особо не старается оправдаться, и довольно живо ретируется, когда ему это указывают. Вероятно, прав был Чацкий, разговаривая, что Софья не почитает Молчалина, а такое чувство никак не помогает помилованию.