Имеется один великий ящик. В нем лежат еще два наименьших ящика.

Первый ящик заполненный
Так как в каждом заполненном ящике всего два ящика, то один из их заполненный, а один незаполненный. Т.е. в каждом заполненном ящике есть 1 незаполненный и 1 заполненный. Т.к. число незаполненных ящиков окончательное, в заключительном заполненном ящике находятся два незаполненных ящика. Т.е. количество незаполненных ящиков на 1 больше, чем количество заполненых.
Т.е. заполненных ящиков 12.