Почему в слове от времЕни пишется буковка е в суффиксе

Существительные третьего склонения, кончающиеся на -МЯ, имеют особенности: они во всех падежах, не считая И.п и В.п в ед числе имеют перед окончанием наращение -ЕН-. Ранее все эти слова кончались на -ЕН (не знамя, время, пламя, а знамен, пламен, времен). Со временем этот единичный звук преобразовался в -Я в 2-ух падежах, в других он остался на прошлом месте, так как был не в конце, а стоял перед гласным звуком. Это написание надобно уяснить. Таких слов только 10.