Протокол состав слова.

Корень это основная означаемая часть слова, в которой заключено общее значение всех однокоренных слов.

Чтоб верно выделить корень, необходимо:
1) узнать лексическое значение слова;
2) подобрать однокоренные (схожие) слова;
3) определить общую часть этих слов.

Протокол - протоколист, протокольный, запротоколировать.

Корень - протокол;
окончание - нулевое;
база слова - протокол.