При каждой вспышке молнии не только Млечный Путь, но и яркие

 [При каждой вспышке молнии не только Млечный Путь, но и ясные звёзды пропали, но, (, как только потухала молния), вновь появлялись на тех же местах].

Предложение повествовательное, невосклицательное, трудное, состоит из 2-х предложений, связанных подчинительной связью, СПП с союзными словами как только: 1 часть - основная, двусоставная, распространённая, неполная, осложнена однородными подлежащими и сказуемыми; 2 часть - придаточная обстоятельственная медли, в интерпозиции, двусоставная, распространённая, полная, не осложнена.

Схема предложения: [  не только -, но - = , но, (как только = - ),  =  ].