What time have you finished your work? либо What time do

What time do you finish your work?

Когда ты заканчиваешь работу?

Объяснение: Present Perfect Tense (истиннее абсолютное время) служит для того, чтоб сказать о деяниях в прошедшем без четкого указания медли. В вопросительном предложении как раз таки время и спрашивается. Поэтому верным будет внедрение второго варианта - сказуемое в Present Simple Tense (простом настоящем времени).