Основное же затруднение состояло в том что Дунечка вступив прошлого года

Главное же затруднение состояло в том, что Дунечка, вступив прошлого года в их дом гувернанткой, брала вперед целых 100 рублей, под условием каждомесячного вычета из жалованья, и, стало быть, нельзя было место бросить, не расплатившись с долгом.

(Что?) затруднение - подлежащее (имя существительное).

Затруднение (Что делало?) состояло - сказуемое (глагол).

Затруднение (Какое?) основное - определение (имя прилагательное).

Состояло (В чем?) в том - добавленье (местоимение).

(Кто?) Дунечка - подлежащее (имя существительное).

Дунечка (Что сделала?) брала - сказуемое (глагол).

Брала (Как?) вступив прошедшего года в их дом гувернанткой - развернутое обстоятельство (деепричастный оборот).

Брала (Как?) вперед - событие (наречие).

Взяла (Что?) 100 рублей - дополнение (числительное + имя существительное).

100 рублей (Каких?) целых - определение (имя прилагательное).

Брала (Как?) под условием ежемесячного вычета из жалованья - развернутое обстоятельство (вводная конструкция).

Стало быть - вводное слово, не является членом предложения.

(Что сделать?) нельзя было оставить - сказуемое (глаголы).

Оставить (Что?) место - прибавление (имя существительное).

Бросить (Как?) не расплатившись с длинном - развернутое событие (деепричастный оборот).